どうもGoogle Mapのルート検索だと国を超えた場合に不正確なルートと時間しかでないようです(例:アムステルダムーブリュッセル間が6時間とか、実際は2−3時間)。
このため、オランダ国内の移動やベルギーとの移動には現地のサイトを利用した方が便利です。
乗換案内9292(英語)
英語で検索できるのでなかなか便利かと思います。オランダ国内のみの場合には電車代も表示されます。
アムステルダムとブリュッセル間で検索すると直行便の他、デンハーグHS乗換もしくはロッテルダム乗換が表示されます。
アムステルダムは便利ですがアパート代も高いため、乗換駅であるデンハーグやロッテルダム近辺を拠点にするというのも一つありかなと思っています。